El Sistema Nacional de Integridad (SNI) son todas aquellas instituciones y prácticas que funcionan de manera interrelacionada para proteger a la sociedad de la corrupción. Si el sistema depende en su totalidad de una o pocas instituciones o 'pilares', éste sera débil y corre el riesgo de colapsar.

Los SNI ofrecen un nuevo enfoque de diagnóstico y una solución potencial para la corrupción. En lugar de analizar instituciones por separado, estudian las interrelaciones, la interdependencia y la efectividad combinada en un enfoque integral. Para establecer un SNI sólido se debe hacer hincapié en una "rendición de cuentas horizontal", en donde el poder está distribuido, en donde ningún actor en particular detenta un monopolio y todos comparten responsabilidades.

La metodología propuesta por Transparency International consiste en responder preguntas para poder analizar la corrupción en cada "pilar" del sistema, lo que permite obtener una comprensión del marco legal por un lado y las prácticas vinculadas al fenómeno, por otro.